除了通过陆路运输以外，上海水路运输亦是保供上海重要的保供通道。4月11日，又出延伸和太仓港管委会联合发布了《沪太两港关于合力提升水路保供保畅能力的新策向外通告》，制定了相应的略太绿色通道、优先服务等措施。仓港成中

该通告指出，转站周边企业经过太仓港转运进入上海港可享绿色通道，空箱其中包括陆路绿色通道、服务范围水上绿色通道等不同内容，上海同时提供优先靠泊服务、保供减免相关费用等措施。又出延伸

具体来看，新策向外自4月8日12时起，略太在“苏货通”平台启用“苏货码”太仓港专用标识，仓港成中司乘人员持此标识可从苏州市域范围范围内各应急保供专用通道（车道）通行。

另外，上海上港长江多式联运有限公司、上海港太仓服务中心、太仓港太申快航服务平台等企业，在确保27条穿巴运力的基础上，根据需要及时增加运力或对外采购舱位。集装箱抵达太仓港后，须68小时内完成、黄浦江港区的转运任务，60小时内完成洋山港区的转运任务。

通知还指出，太仓港为所有长江中上游支线班轮提供集并中转上海港服务。同时，对长江中上游和安吉、湖州内河港口通过太申快航往来外高桥、黄浦江港区的普通集装箱，太仓港中转费统一执行60元/小箱、90元/大箱的标准。

除此之外，通知指出要提供两港空箱一体化的服务，包括保障外贸出口企业用箱需求，按需调运空箱到太仓港，纾解企业用箱压力。并启动“上海港东北亚空箱调运中心——太仓港分中心”的空箱调运模式，上海港将太仓港视为本港空箱服务延伸区，并协商船公司最大程度降低进出口企业在太仓港的用箱成本。

疫情以来，公路货运存在堵点，水路运输的重要性更加凸显，路改水的运输模式也成为纾解运输难题的另一种方式。3月中旬，上港集团就宣布推出“集装箱路改水”服务，缓解因疫情影响造成的上海港公路运输资源紧缺的压力，该服务涵盖上海港洋山片区、外高桥片区各码头至长江及长三角区域相关港口。

此外， 据中远海运公布的数据，该公司旗下泛亚航运，在长江沿线55个港口都开通了“路改水”服务，通过水运和海运铁联运的方式，将大米、食用油、蔬菜等抗疫、民生物资从长三角周边地区和全国各地紧急运往上海。

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